《"真人教育"的理论探索与实践》是引领行知中学发展的主导性实验课题。学校发扬行知优秀的办学传统，融入时代特征，以陶行知教育思想为灵魂，在实践中不断丰富和发展"真人"的时代内涵，形成了有行知特色的"培养真挚的感情，锤炼真诚的品行，掌握真实的本领"的"真人"三环系列的育人目标，它已成为行知特色人才培养的出发点和学校文化特色。 行知中学从学校校情和当前教育基本现状的实际出发，研究陶行知教育思想和现代教育的结合点，探讨陶行知教育思想的现代价值，实施"真人教育"，逐渐形成了"学习陶行知，求真做真人;学习宝钢人，面向现代化"的办学特色。
2001年3月，学校顺利通过了上海市创建实验性示范性高中规划评审，同时被市教委确定为面向全国招生的重点学校。跨入新世纪的行知中学，在继承行知优良传统的基础上，充分挖掘学生自主学习、自我管理的潜能，在实施素质教育的轨道上探索前进，开拓创新。
2006年，由宝山区教育局局长张步华担任校长，对学校进行了硬件方面的大改进，新建了教学楼、食堂、宿舍、图书馆等。使学校更加现代化与美观。
2008年，学校被选为奥林匹克示范学校(上海仅有两所)。
2009年，学校与大学建立合作发展的共同体，与上海其它24所重点高中一起组成了和国家"211工程"重点大学--上海大学的自主招生选拔联盟，实现高中教育和大学教育的衔接，为培养，高素质，复合型，创新型学生提供了途径。
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